Alates esimesest koroonaviirushaiguse juhtumist 2019. aasta detsembris on pandeemiline haigus levinud miljonite inimesteni kogu maailmas.See romaani ülemaailmne pandeemiaraske ägeda respiratoorse sündroomi koroonaviirus 2 (SARS-CoV-2)on tänapäeva üks mõjuvamaid ja murettekitavamaid ülemaailmseid tervisekriise, mis kujutab endast suurt ohtu maailmale ja mõjutab kõiki inimelu aspekte.[1]
Koronaviirused on ümbrisega positiivse sensatsiooniga üheahelalised RNA-viirused perekonnast Coronaviridae, millel on lai peremeeste spekter, nagu inimesed, nahkhiired, kaamelid ja linnuliigid, sealhulgas kariloomad ja seltsilised, mis ohustavad rahva tervist. 1 Koronaviirused klassifitseeritakse Orthocoronavirinae alamperekonda, mis jaguneb valgujärjestuse erinevuste põhjal nelja perekonda: a-koronaviirus, b-koronaviirus, g-koronaviirus ja d-koronaviirus.A-koronaviirused ja b-koronaviirused nakatavad ainult imetajaid, samas kui g-koronaviirused ja d-koronaviirused nakatavad peamiselt linde, kuigi mõned neist võivad nakatada ka imetajaid.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV ja SARS-CoV-2 on seitse koronaviirust, mis on tuvastatud inimesi nakatavatena.Nende hulgas on 2002. ja 2012. aastal inimpopulatsioonis esile kerkinud SARSCoV ja MERS-CoV väga patogeensed.Kui inimpopulatsioonis ringlevad inimese koroonaviiruse (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 või HCoV-HKU1 tüved põhjustavad ainult tavalist külmetust,7 raske ägeda respiratoorse sündroomi koroonaviirus 2 (SARS-CoV2), mis on haiguse põhjustaja. COVID-19 on uudne b-koroonaviirus, mis ilmus varakult 2019. aasta lõpus ja on põhjustanud laastavaid surmajuhtumeid.Peamised sümptomidCOVID 19on sarnased SARS-CoV ja MERS-CoV omadele: palavik, väsimus, kuiv köha, valu rinnus, mõnikord kõhulahtisus ja hingeldus.Erinevalt minevikustkoroonaviiruse (CoV) infektsioonid, nõuab SARS-CoV-2 kiire ülemaailmne levik, kõrge levikukiirus, pikem inkubatsiooniaeg, asümptomaatilisemad infektsioonid ja haiguse raskusaste põhjalikke teadmisi viiruse immuunsuse vältimise strateegiate kohta.
Sarnaselt teistele inimese koroonaviirustele (SARS-CoV-2, MERS-CoV), on ka SARSCoV-2-l üheahelaline, umbes 30 kb suurune positiivse meelega RNA genoom.Nagu on näidatud joonisel 1, ühendavad viiruse nukleokapsiidi (N) valgud genoomi suureks ribonukleoproteiini (RNP) kompleksiks, mis on seejärel ümbritsetud lipiidide ja viirusvalkudega S (spike), M (membraan) ja E (ümbris).Genoomi 50 otsas on kaks suurt avatud lugemisraami (ORF), ORF1a ja ORF1b, mis kodeerivad polüpeptiide pp1a ja pp1b, mis toodetakse 16 mittestruktuurseks valguks (NSP), mis hõlmavad kõiki viiruse replikatsiooni aspekte viiruse proteaaside NSP3 ja NSP5 poolt, mida sisaldavad. vastavalt papaiinitaoline proteaasi domeen ja 3C-sarnane proteaasi domeen.9 Genoomi 30 ots kodeerib struktuurvalke ja lisavalke, millest ORF3a, ORF6, ORF7a ja ORF7b on tõestatud, et need on seotud viiruse struktuurvalgud viirusosakeste moodustamisel ning ORF3b ja ORF6 toimivad interferooni antagonistidena.Vastavalt praegusele annotatsioonile, mis põhineb järjestuse sarnasusel teiste b-koronaviirustega, sisaldab SARS-CoV-2 kuue lisavalgu (3a, 6, 7a, 7b, 8 ja 10) prognoose.Kuid kõiki neid ORF-e pole veel eksperimentaalselt valideeritud ja SARS-CoV-2 lisageenide täpne arv on endiselt vaidlusküsimus.Seetõttu on siiani ebaselge, milliseid lisageene see kompaktne genoom tegelikult väljendab.[2]
Väga tundlikud ja spetsiifilised testid on üliolulised COVID-19 patsientide tuvastamiseks ja haldamiseks ning haiguspuhangu piiramiseks tõrjemeetmete rakendamiseks.Hoolduspunkti (POC) molekulaartestid võimaldavad laboripõhiste diagnostikameetoditega võrreldes varem tuvastada ja eraldada kinnitatud SARS-CoV-2 juhtumeid, vähendades seeläbi levikut majapidamises ja kogukonnas.
[1] SARS-CoV-2 kiire avastamise kliiniline ja operatiivne mõju kiirabiosakonnas
[2] Võitlus peremeesorganismi ja SARS-CoV-2 vahel: kaasasündinud immuunsus ja viirusest kõrvalehoidmise strateegiad
Postitusaeg: 25. mai-2022